SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh37

DOI:10.18129 / B9.bioc.SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh37

这是发展SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh37版本;稳定的发布版本,请参阅SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh37

人类SNP位置和等位基因提取dbSNP建造155和放在GRCh37 / hg19组装

Bioconductor版本:发展(3.18)

这个包的929496192个snp从RefSNP JSON文件中提取染色体22页,X, Y,和山,位于https://ftp.ncbi.nih.gov/snp/archive/b155/JSON/(这些文件是由NCBI 2021年5月)。这些snp可在BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19“注入”。

作者:Herve页面

维护人员:< hpages.on Herve页面。github在gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh37”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh37”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

PDF 参考手册

细节

biocViews AnnotationData,遗传学,Homo_sapiens,SNPlocs
版本 0.99.24
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 4.2.0),BSgenome(> = 1.67.2)
进口 方法,跑龙套,BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges,BSgenome
链接
建议 Biostrings,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我 motifbreakR,MungeSumstats
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包档案

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源包 SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh37_0.99.24.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh37/
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