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- Bioconductor 3.16
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- SNPlocs.Hsapiens.dbSNP150.GRCh38(development version)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP150.GRCh38
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DOI:10.18129 / B9.bioc.SNPlocs.Hsapiens.dbSNP150.GRCh38
这是发展SNPlocs.Hsapiens.dbSNP150.GRCh38版本;稳定的发布版本,请参阅SNPlocs.Hsapiens.dbSNP150.GRCh38。
SNP地点智人(dbSNP构建150)
Bioconductor版本:发展(3.16)
SNP等位基因位置和智人从NCBI dbSNP建造150。源数据文件用于这个包是由NCBI之间3月12 - 14,2017,包含snp GRCh38映射到参考基因组。p7 (GRCh38的补丁版本,并不改变染色体22页,X, Y, MT)。注意,这些单核苷酸多态性可以在BSgenome.Hsapiens.NCBI“注入”。GRCh38或BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38。
作者:Herve页面
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安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP150.GRCh38”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
| 参考手册 |
细节
| biocViews | AnnotationData,遗传学,Homo_sapiens,SNPlocs |
| 版本 | 0.99.20 |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | BSgenome(> = 1.43.4) |
| 进口 | 方法,跑龙套,BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges,BSgenome |
| 链接 | |
| 建议 | Biostrings,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | trena |
| 建议我 | |
| 我的链接 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | SNPlocs.Hsapiens.dbSNP150.GRCh38_0.99.20.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS 10.13(高山脉) | |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SNPlocs.Hsapiens.dbSNP150.GRCh38/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
