EuPathDB

DOI:10.18129 / B9.bioc.EuPathDB

这是发展EuPathDB版本;稳定的发布版本,请参阅EuPathDB

提供对病原体的访问注释EuPathDB数据库上的可用资源

Bioconductor版本:发展(3.17)

汇集了从各种EuPathDB注释资源数据库(PlasmoDB、ToxoDB TriTrypDB,等等),使它们可用于R使用AnnotationHub框架。

作者:基斯Hughitt (aut (cre)

维护人员:基斯Hughitt <基斯。在gmail.com hughitt >

从内部引用(R,回车引用(“EuPathDB”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“EuPathDB”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“EuPathDB”)

HTML R脚本 使用AnnotationHub EuPathDB资源的访问
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