ENCODExplorerData

DOI:10.18129 / B9.bioc.ENCODExplorerData

这是发展ENCODExplorerData的版本;稳定版请参见ENCODExplorerData．

ENCODE元数据的编译

Bioconductor版本:开发(3.17)

这个包允许用户快速访问ENCODE项目文件元数据，并允许访问帮助函数来查询ENCODE rest api，下载ENCODE数据集并以SQLite格式保存数据库。

作者:Charles Joly Beauparlant [aut]， Eric Fournier [aut, cre]， Arnaud Droit [aut]

维护者:Eric Fournier

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("ENCODExplorerData")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ENCODExplorerData”)

超文本标记语言		ENCODExplorerData简介
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AnnotationData，AnnotationHub，CustomDBSchema，Homo_sapiens，Mus_musculus
版本	0.99.5
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.6)
进口	工具,jsonlite，RCurl，data.table、方法
链接
建议	AnnotationHub，RUnit，BiocGenerics，knitr，旋度，httr
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/ArnaudDroitLab/ENCODExplorerData/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ENCODExplorerData_0.99.5.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ENCODExplorerData/
软件包下载报告	下载数据