BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10

这是发展BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10版本;稳定的发布版本,请参阅BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10。

亩进行全基因组序列(mm10 UCSC的版本,基于GRCm38.p6)

Bioconductor版本:发展(3.16)

完整基因组序列亩肌肉(鼠标)提供的UCSC (mm10,基于GRCm38.p6)并存储在Biostrings对象。

作者:Bioconductor Dev团队

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData,BSgenome,遗传学,Mus_musculus
版本	3
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5.0),BSgenome(> = 1.60.0)
进口	BSgenome
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10.masked
进口我	BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10.masked,GeneStructureTools,musicatk,trena
建议我	AneuFinder,BSgenome,circRNAprofiler,CRISPRseek,enhancerHomologSearch,gcapc,GenomicRanges,GRaNIE,HiCDCPlus,InPAS,m6Aboost,海市蜃楼,蒙娜丽莎,Motif2Site,multicrispr,NADfinder,periodicDNA,scanMiRApp,scmeth,范围,SingleMoleculeFootprinting
我的链接

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10_1.4.3.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10/
包下载报告	下载数据