BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38

这是发展BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38版本;稳定的发布版本,请参阅BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38。

完整的基因组序列智人(hg38 UCSC的版本,基于GRCh38.p13)

Bioconductor版本:发展(3.17)

完整基因组序列智人(人类)提供的UCSC (hg38,基于GRCh38.p13)并存储在Biostrings对象。

作者:Bioconductor Dev团队

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData,BSgenome,遗传学,Homo_sapiens
版本	1.4.4
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5.0),BSgenome(> = 1.60.0)
进口	BSgenome
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.masked
进口我	分歧点,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.masked,katdetectr,musicatk,ORFhunteR,primirTSS,trena
建议我	BSgenome,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.dbSNP151.major,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.dbSNP151.minor,bsseq,BUSpaRse,cfDNAPro,ChIPpeakAnno,circRNAprofiler,cn,crisprBowtie,crisprBwa,crisprDesign,crisprViz,eisaR,enhancerHomologSearch,EpiCompare,EpiTxDb,GenVisR,GRaNIE,GUIDEseq,HiCDCPlus,MethReg,Motif2Site,multicrispr,periodicDNA,pqsfinder,REMP,scanMiRApp,范围,签名者,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP149.GRCh38,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP150.GRCh38,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh38,supersigs,TAPseq,Ularcirc,XNAString,XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38
我的链接

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38_1.4.4.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38/
包下载报告	下载数据