bsgenome.hsapiens.ucsc.hg17.masked

doi:10.18129/b9.bioc.bsgenome.hsapiens.ucsc.hg17.masked

这是发展bsgenome.hsapiens.ucsc.hg17.masked的版本;对于稳定版本,请参阅bsgenome.hsapiens.ucsc.hg17.masked

Homo Sapiens的完整蒙版基因组序列(UCSC版本HG17)

生物导体版本:开发(3.16)

UCSC(HG17,2004年5月)提供的Homo Sapiens(人)的完整基因组序列,并存储在生物弦对象中。这些序列与bsgenome.hsapiens.ucsc.hg17中的序列相同,除了每个序列在顶部都有4个接下来的掩码:(1)组装间隙的掩码(agaps mask)(agaps mask),(2)contra内部掩码歧义(Ambmask),(3)RepotMasker(RM Mask)的重复掩码,以及(4)串联重复搜索器(TRF蒙版)的重复掩码。默认情况下,只有agaps和amb掩模是“活动”的。

作者:生物导体开发团队

维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

引用(从r内,输入引用(“ bsgenome.hsapiens.ucsc.hg17.masked”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install(version(version ='devel')biocmanager :: install(“ bsgenome.hsgenome.hsapiense)).ucsc.hg17.masked”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

PDF 参考手册

细节

生物浏览 AnnotationData,,,,BSGENOME,,,,遗传学,,,,homo_sapiens
版本 1.3.99
执照 艺术2.0
要看 BSGENOME(> = 1.31.8),bsgenome.hsapiens.ucsc.hg17
进口 BSGENOME,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg17
链接
建议
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 bsgenome.hsapiens.ucsc.hg17.masked_1.3.99.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/bsgenome.hsapiens.ucsc.hg17.masked/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网