这是发展bsgenome.hsapiens.ucsc.hg17.masked的版本;对于稳定版本,请参阅bsgenome.hsapiens.ucsc.hg17.masked。
生物导体版本:开发(3.16)
UCSC(HG17,2004年5月)提供的Homo Sapiens(人)的完整基因组序列,并存储在生物弦对象中。这些序列与bsgenome.hsapiens.ucsc.hg17中的序列相同,除了每个序列在顶部都有4个接下来的掩码:(1)组装间隙的掩码(agaps mask)(agaps mask),(2)contra内部掩码歧义(Ambmask),(3)RepotMasker(RM Mask)的重复掩码,以及(4)串联重复搜索器(TRF蒙版)的重复掩码。默认情况下,只有agaps和amb掩模是“活动”的。
作者:生物导体开发团队
维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>
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):
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if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install(version(version ='devel')biocmanager :: install(“ bsgenome.hsgenome.hsapiense)).ucsc.hg17.masked”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
参考手册 |
生物浏览 | AnnotationData,,,,BSGENOME,,,,遗传学,,,,homo_sapiens |
版本 | 1.3.99 |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | BSGENOME(> = 1.31.8),bsgenome.hsapiens.ucsc.hg17 |
进口 | BSGENOME,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg17 |
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源包 | bsgenome.hsapiens.ucsc.hg17.masked_1.3.99.tar.gz |
Windows二进制 | |
MacOS 10.13(高山脉) | |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/bsgenome.hsapiens.ucsc.hg17.masked/ |
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