BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau9.masked

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau9.masked

这是发展BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau9.masked版本;稳定的发布版本,请参阅BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau9.masked。

完全掩盖了牛的基因序列(bosTau9 UCSC的版本)

Bioconductor版本:发展(3.18)

完整基因组序列牛(牛)提供的UCSC基因组bosTau9和存储在Biostrings对象。BSgenome.Btaurus.UCSC序列是一样的。bosTau9,除了他们每个人上面具后的4:(1)装配间隙的面具(AGAPS面具),(2)的面具intra-contig模棱两可(AMB面具),(3)重复的面具RepeatMasker (RM面具),和(4)串联重复序列的重复的面具仪(扶轮基金会面具)。只有AGAPS和AMB面具默认是“活跃”的。

作者:Bioconductor Dev团队

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau9.masked”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData,BSgenome,Bos_taurus,遗传学
版本	1.4.4
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5.0),BSgenome(> = 1.62.0),BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau9
进口	BSgenome,BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau9
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包档案

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源包	BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau9.masked_1.4.4.tar.gz
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macOS二进制(arm64)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau9.masked/
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