AHLRBaseDbs

DOI:10.18129 / B9.bioc.AHLRBaseDbs

这是发展AHLRBaseDbs版本;稳定的发布版本,请参阅AHLRBaseDbs。

为AnnotationHub LRBaseDbs

Bioconductor版本:发展(3.17)

供应AnnotationHub与“LRbaseDb”中的注释数据库对许多物种。我们所有的SQLite文件生成Snakemake工作流(lrbase-workflow) (https://github.com/rikenbit/lrbase-workflow)。有关细节,请参见README。lrbase-workflow的md。

作者:露崎引人入胜(aut (cre) Manabu Ishii (aut) Itoshi Nikaido (aut)

维护人员:< k.t露崎引人入胜。答案在hotmail.co.jp >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“AHLRBaseDbs”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“AHLRBaseDbs”)

HTML	R脚本	提供AnnotationHub LRBaseDb数据库
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AnnotationData,AnnotationHub,FunctionalAnnotation,LRBaseDb
版本	1.5.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.1.0)
进口	AnnotationHub(> = 2.22.0)
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/rikenbit/AHLRBaseDbs/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	AHLRBaseDbs_1.5.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/AHLRBaseDbs/
包下载报告	下载数据