# # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -库(TSCAN)数据(lpsdata) procdata < -预处理(lpsdata) # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - lpsmclust < - exprmclust (procdata) # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - plotmclust (lpsmclust) # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - lpsorder < - TSCANorder (lpsmclust) lpsorder # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - diffval < - difftest (procdata lpsorder) #选择下的差异表达基因qvlue截止0.05头(row.names (diffval) [diffval qval < 0.05美元)# # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - STAT2expr < - log2 (lpsdata (“STAT2”) + 1) singlegeneplot (STAT2expr, TSCANorder (lpsmclust翻转= TRUE, orderonly = FALSE)) # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - < - - - - - - -群data.frame(细胞= colnames (procdata),子= ifelse (grepl(“如果”,colnames (procdata)), 0, 1), stringsAsFactors = FALSE) #比较排序有或没有标志基因信息order1 < - TSCANorder (lpsmclust) order2 < - TSCANorder (lpsmclust c(1、2、3) < -订单列表(order1 order2) # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - orderscore(分组人口,订单)