# # - - - - -图,fig.cap =“注释包之间的关系”,回声= FALSE——knitr: include_graphics (relationships-between-annotation-packages.png) # #——列,消息= FALSE,警告= FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -库(Homo.sapiens)列(Homo.sapiens) # #——keys1,消息= FALSE,警告= FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - keytypes (Homo.sapiens) # #——keys2,消息= FALSE,警告= FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -头(键(Homo。智人,keytype = " ENTREZID ")) # #——选择,消息= FALSE,警告= FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - k(键(Homo < -头。智人,keytype = " ENTREZID”), n = 3)选择(Homo。智人,键= k,列= c (“TXNAME”、“符号”),keytype =“ENTREZID”) # #——成绩单,消息= FALSE,警告= FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -记录(Homo。智人,列= c (“TXNAME”、“符号”))# #——transcriptsBy,消息= FALSE,警告= FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - transcriptsBy (Homo。智人,由= "基因",列= c (“TXNAME”、“符号”))# #——setupColData,消息= FALSE,警告= FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - gd < -列表(join1 = c(走。org.Hs.eg db = " GOID "。db =“走”),join2 = c (org.Hs.eg。TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19 db = " ENTREZID "。knownGene = " GENEID ")) # #——makeOrganismPackage, eval = FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - #目的地< - tempfile () # dir.create(目的地)# makeOrganismPackage (# pkgname = "人类。智人”,# graphData = gd, #生物=“智人”,# version = " 1.0.0 " #维护者= "包维护者
一些身体“作者# = # destDir =目的地,#许可证= "艺术- 2.0”#)