## ----样式，回声= false，结果=“asis”，消息= false，警告= false ------- knitr :: opts_chunk $ set（tidy = false，警告= false，message = false，fig.width = 6，fig.height = 6）## ----集大小------------------------------------------------------------ knitr :: opts_knit $ set（width = 80）## ----安装，eval = false，echo = true，包括= true ---------------------------＃if（！quancenamespace（“biocmanager”，安静地= true））#sipling.packages（“biocmanager”）＃biocmanager ::安装（“norce”）## ----加载，eval = true，echo = true，包括= true --------------------------------------------加载包，equ = true，echo =真实，包括=真 - - - - - - - - 图书馆（Norce）## ----基于基因邻域时的浓缩分析由基因组成，eval = true，回声= false ---- ncgo <-genegoenrichercormer（基因= brain_disorder_ncrna，org_assembly ='hg19'，近= true，genetype ='ensembl_gene'）## -----最近的交叉点输入基因集的基因和潜在的TARGet集是进行浓缩分析，eval = True ---- Mirgo <-Mirnagoenricher（Gene = Brain_mirna，Org_Assembly ='HG19'，近= True，Target = True）## ----检索单元格列表 -线，eval = true ----------------------------- a <-listtad（tadname = tad_hg19）##----基于TAD Cellline的浓缩，eval = True ---------------------------- Mirgo <-MirnagoNicher（基因= Brain_mirna，org_assembly ='hg19'，靠近= true，istadsearch = true，tad = tad_hg19）## ----基于落入Tad地区的Gen集的沟通丰富，eval = true ---- Ncrnapathway <-GenePathwayenricher（基因= brain_disorder_ncrna，org_assembly ='hg19'，istadsearch = true，tad = tad_hg19，genetype ='ensembl_gene'）## ----自定义关联分析，eval = true，回声= true ------------------------ Datacor < - CalculatecorR（Exp1 = miRNA [，1：50]，Exp2 = mRNA [，1：50]）