这个包提供了保存和操作Illumina甲基化数据的类。基于eSet，它可以包含MIAME信息、样本信息、特征信息以及多个数据矩阵。作为一个“智能”导入函数，methylumiR可以读取Illumina文本文件并创建MethyLumiSet。methylumIDAT可以直接从HumanMethylation27和HumanMethylation450微阵列读取原始IDAT文件。还包括GoldenGate, Infinium和Infinium HD阵列的归一化，背景校正和质量控制功能。