版本变化1.17.22化妆品(2019-01-24)o代码消除错误和警告的R CMD BiocCheck 3.9版。版本变化1.13.02 (2017-11-20)o消除c++ -11和Rcpp链接。通过单元测试。o使用lower_bound_函数导出 版本变化1.9.15 (2017-04-21)o添加prozor(> = 0.2.2)建议列表。o添加更具体的R包描述文件的版本号。o在阴谋。specLSet(规范化RT与RT)使用pch = 16和颜色参数α= 0.1。o固定问题# 22 ionlibrary包括红外热成像的;自由< - genSwathIonLib (data = peptideStd data.fit = peptideStd.redundant);LIB@input.parameter iRTpeptides美元。# 19 o固定问题。o par命令在specLset绘制函数。o添加小品文/报告。限制型心肌病文件,参见 。1.7.4变化版本(2016-05-19)o用户可见的变化•添加到specLSet总结”性病肽(红外热成像)发现在原始文件”•一块原始文件版本的情节specLSet对象的方法改变1.7.1上(2016-05-13)o用户可见的变化•新闻的新闻所取代。Rd /替换诱饵文件•修改specL对象属性# 1,# 4•specL BioC 3.3版本的变化1.5.10-13 o用户UNVISIBLE变化•添加specLSet类支持cdsw方法•改变Rmd5装饰图案风格•cdsw添加测试用例•cdsw方法介绍新的一幕 o版本变化1.5.9之后读取用户UNVISIBLE变化•添加测试用例。biliospec 1.5.5 o版本用户可见的变化改变•添加RT预测小插图文件版本变化1.5.4 o用户UNVISIBLE更改•改变名称空间和阅读。bibliospec docu避免警告在版本3.3检查更改1.5.3 o更正用户UNVISIBLE变化•添加sqlite文件peptideStd RData # 13版本变化1.5.2 o用户UNVISIBLE更改•找到所有信号有两个或两个以上in-silico碎片离子。# 8•只保留最近的碎片离子;如果有更多的把第一行的变化版本1.3.7 o用户UNVISIBLE变化•getProteinPeptideTable -添加用户UNVISIBLE更改•阿1.3.5版本的变化阅读。bibliospec——修正版本1.3.4 o用户可见的变化改变维托尔德•添加Wolski维护者o用户UNVISIBLE变化•阅读。bibliospec——取代旧代码(循环)通过使用mcmapply meassurements•添加时间阅读。bibliospec v1.3.3 o用户可见的变化改变•图::specLSet绘制阿尔法圆iff情节(…、艺术= TRUE) o用户UNVISIBLE变化•.mascot2psmSet buxfix•更名为列名在spectronaut outpu从红外热成像irt_or_rt 1.3.2 o用户可见的变化•添加版本的变化,科学分析和研究中心(序列特定保留计算器)函数•添加一个引用文件版本变化1.3.1 o用户可见的变化•添加因数cdsw o用户UNVISIBLE变化•修改单元测试genSwathIonLib变化版本1.1.17 o用户UNVISIBLE•genSwathIonLib函数中删除文件参数变化在版本1.1.16 o用户UNVISIBLE变化•添加单元测试genSwathIonLib变化版本1.1.15 o用户UNVISIBLE变化•添加圆块在genSwathIonLib specLSet阴谋方法•添加优惠参数方法的变化版本用户UNVISIBLE更改•阿1.1.14 LinkedTo Rcpp;添加c++ STL下界函数询问确定重叠q1和q3片windows版本1.1.13 o用户可见的变化改变•固定手册页版本1.1.12 o用户可见的变化改变•提高包小插图版本1.1.11 o用户可见的变化改变genSwathIonLib••修改默认参数添加内容的装饰图案变化版本1.1.10 o•添加生成用户可见的变化。共识的变化版本1.1.9 o•新功能用户可见的变化specLSet“总结”情节o用户•重构merge.specLSet UNVISIBLE变化;group_id•添加单元测试合并的合并。specLSet 1.1.8 o版本用户可见的变化改变•更名为annotateProteinID注释。protein_id•添加图形的阴谋。specLSet method o USER UNVISIBLE CHANGES • refactored merge Changes in version 1.1.7 o USER VISIBLE CHANGES • introduce peakplot for bibliospec object • introduce LCMS map for bibliospec object • vignette cosmetics Changes in version 1.1.6 o USER VISIBLE CHANGES • introduce specL_bibliospec summary method Changes in version 1.1.5 o USER VISIBLE CHANGES • specLSet merge function • work on specLSet summary method Changes in version 1.1.4 o USER VISIBLE CHANGES • summary method of specLSet class o USER UNVISIBLE CHANGES • unit test for data containing no iRT peptides Changes in version 1.1.3 o USER VISIBLE CHANGES • renamed write.Spectronaut to write.spectronaut • write.spectronaut writes filename • added benchmark section in package vignette Changes in version 1.1.2 o USER VISIBLE CHANGES • uses modSeq in group_id iff existing Changes in version 1.1.1 o USER VISIBLE CHANGES • streamline modsequence, e.g., AAAMASATTM[+16.0]LTTK for compatibility with peakView V2.0 Changes in version 0.99.23 o USER VISIBLE CHANGES • added methods for specLSet class: ionlibrary, rt.input, rt.normalized • fixed Sys.time() units in message. o USER UNVISIBLE CHANGES • genSwathIonLib using bpmapply Changes in version 0.99.22 o USER VISIBLE CHANGES • specLSet plot method Changes in version 0.99.21 o USER VISIBLE CHANGES • specLSet class • replace print by show and write.Spectronaut method in specL and specLSet classes