版本1.13.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o固定导= FALSE指导=“没有”。版本1.13.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o固定在computeDiffStats bug。版本1.9.4 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o文档添加新的数据集。1.9.3版本- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o新功能:添加函数IRSnorm,跨多个TMT执行强度正常化运行使用一个共同的参照样本规模(内部参考)。1.9.2版本- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o Bug修复:更新getContrastResults is_validScalingFunction测试引用o修复Bug——从“are_equal”切换到“相同的”版本1.9.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o修复Bug在getContrastRestults文件写入的。txt”,文件名称现在应该正确形成的对比名称版本1.15.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o修复错误devtools::检查测试引起的不同的地区版本1.7.1上- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o装饰图案改为HTML o添加corrPlot o textsize参数允许扩展中的遗漏值正常化版本1.3.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o mergePeptides添加到名称空间1.3.1版本- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o添加mergePeptides函数总结相同肽单肽为特定蛋白质。1.1.2版本- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -更新装饰图案来避免构建错误当试图连接到Uniprot版本1.1.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o maVolPlot固定错误——github问题12:以前的selectedGenes参数用GeneSymbols匹配基因强调情节。并不是所有的财产增益有GeneSymbol,有些GeneSymbols与一个以上的加入。这可能导致不正确的情况下基因被强调了由于重复的条目或NAs。现在的函数接受和火柴到达现在——这是指出手册页。o convertToMSnset固定错误——github问题11:函数之前把和错误如果元数据是一个宠物猫,因为它需要设置行名称。 The function now tranforms the metadata object to a data frame. VERSION 1.1.0 ------------------------ o First Bioconductor Devel (Bioconductor 3.9) VERSION 1.0.0 ------------------------ o First Bioconductor Release (Bioconductor 3.8) VERSION 0.99.0 ------------------------ o initial version with the following functions implemented: + convertToMSnset + summarizeIntensities + normalizeQuantiles + normalizeScaling + groupScaling + rowScaling + regressIntensity + computeDiffStats + getContrastResults + assignColours + intensityPlot + intensityBoxplot + peptideIntensityPlot + pcaPlot + maVolPlot + corrPlot + rliPlot + hierarchicalPlot + plotMeanVar + coveragePlot