版本2.3.0的变化------------------------新特性o重构了bootstrap方法,以提高内存使用和减少计算时间。o增加了一个plot_metagene函数,从data.frame生成一个metagene图,以避免总是依赖metagene对象。o弃用range和bin_size参数。o在小插图中增加了新的部分:“管理大型数据集”和“比较配置文件与排列”。删除了不再适用于ggplot2 > 2.2.0的参数。o改变了序列水平检查,以匹配基因组校准的变化。o增加了一个检查提前停止和输出清晰的错误信息时,位置在GRanges大于染色体的大小。change FOR VERSION 2.2.0 ------------------------ o增加了检查,以避免在第一次函数调用后参数仍然相同时产生相同的矩阵或数据帧。o将分析拆分为多个(可选的)中间步骤(add_design, produce_matrices和produce_data_frame)。o现在支持窄峰和宽峰格式。 o Added multiple getter to access metagene members that are all now private (get_params, get_design, get_regions, get_matrices, get_data_frame, get_plot, get_raw_coverages and get_normalized_coverages. o Added the NCIS algorithm for noise removal. o Replaced the old datasets with promoters_hg19, promoters_hg18, promoters_mm10 and promoters_mm9 that can be accessed with data(promoters_????). o Added flip_regions and unflip_regions to switch regions orientation based on the strand.