版本4.5.1的更改 - 关注KEGG API升级，该升级从http更改为https（2022-06-06，MON） - 使用'WinInet'在.platform $ os.type =“ Windows”（2022-06-03，fri）-MV read.gmt and read.gmt.wp到'gson'软件包，并重新删除“ gson”（2022-04-28，thu）的这两个功能 - fix comparecluster fun fun = ronichichpathway（20222--4-28，thu）版本4.4.0的更改 - 生物导体3.15版本4.3.4中的版本更改 - keytype ='symbleable'&& redable = true = true = true（2022-4-9，SAT，SAT）时，请修复Enrichgo，Gsego和GroupGo。版本4.3.3-Parse GAF文件准备GO注释数据（ESP用于蛋白质组学研究）（2022-03-08，TUE，＃397，＃418，＃418，＃421，＃442） - excaleCluster（）中的错误（20222--）01-27，thu，＃424）版本4.3.2中的更改 - extract_params（）（）（2022-01-12，wed，wed，＃392，@AMCDAVID）中修复的错误 - simplify（）在compareCluster中为gsego（）工作（）） - compareCluster（）中GSEA方法的支持公式接口4.3.1- compareCluster（）支持GSEA算法（2021-12-11，SAT） - 更新错误消息的下载错误消息。SimpLify（）函数支持ONT = ALL（2021-10-27，WED）版本4.2.0-生物导体3.14版本4.1.4中的发布更改 - 导入Yulab.utils（2021-08-20，fri）更改版本4.1.3-删除https://github.com/yulab-smu/microbiomeprofiler（2021-08-15，sun）中的功能，删除人类肠道微生物组数据集，版本4.1.2-版本4.1.2-更新引文和描述（Sun）2021-08-15，太阳） - 更新kegg_species.rda，并允许使用Kegg API（2021-08-14，SAT）在线下载版本4.1.1中的更改​​ - 添加引文（创新上发布的新论文）（2021-07）（2021-07-04，Sun）版本4.0.0的更改 - 生物导体3.13版本3.99.1中的发布更改 - 添加新数据集，de_gse8057，其中包含从GSE8057（2020-03-08，MON，MON）获得的DE基因的变化。版本3.99版本3.99。0-添加kegg富集分析人类肠道微生物组数据（2021-02-20，SAT）版本3.19.1的更改 - 将默认超时设置为300供下载（2021-02-05，fri） - 固定下载方法设置 - 能够设置KEGG下载方法通过选项（clusterProfiler.download.method =方法）（2020-12-31，thu）版本3.18.0-Bioconductor 3.12版本（2020-10-28，wed）版本3.17.5-更新 - 更新[[。3.17.3版本中的比较集群（2020-10-14，WED）更改 - 使用Wikipathways（2020-09-09，WED）进行富集分析的内部suports-富集ORA分析-GSEWP用于GSEA分析-GET_WP_ORNISS -GET_WP_ORNISS用于列出支持的生物体 - read.gmt.wp for parsing gmt file downloaded from wikiPathways Changes in version 3.17.2 - use libcurl if capable (2020-09-08, Tue) - https://github.com/YuLab-SMU/clusterProfiler/pull/290 Changes in version 3.17.1 - bug fixed of extract_params (2020-08-18, Tue) - https://github.com/YuLab-SMU/clusterProfiler/issues/282 Changes in version 3.16.0 - Bioconductor 3.11 release Changes in version 3.15.3 - incorporate clusterProfiler.dplyr (2020-03-12, Thu) - arrange, filter, group_by, mutate, rename, select, slice and summarize Changes in version 3.15.2 - remove Suggests of KEGG.db as it will be deprecated in Bioconductor 3.11 (2020-01-14, Tue) - optimize enrichGO to use less memory (2019-12-13, Fri) - re-implement read.gmt without using GSEABase, and my own version is much more fasta :) Changes in version 3.15.1 - e.g. user can pass fun=enrichGO to compareCluster without quoting enrichGO (2019-12-02, Mon) - add keytype and readable info in compareCluster output - mv compareClusterResult class defintion to DOSE (2019-11-02, Sat) - mv fortify, barplot and dotplot for compareClusterResult to enrichplot. Changes in version 3.14.0 - Bioconductor 3.10 release Changes in version 3.12.0 - Bioconductor 3.9 release Changes in version 3.11.1 - asis parameter in [.compareClusterResult (2018-12-24, Mon) - https://github.com/GuangchuangYu/enrichplot/issues/17 Changes in version 3.10.0 - Bioconductor 3.8 release Changes in version 3.9.2 - re-export DOSE::gsfilter and DOSE::setReadable (2018-05-25, Fri) Changes in version 3.9.1 - change color scheme of dotplot of compareClusterResult back to red->purple (2018-05-17, Thu) - https://support.bioconductor.org/p/108996/ Changes in version 3.8.0 - Bioconductor 3.7 release Changes in version 3.7.1 - uniprot_get function (2018-01-30, Tue) - import enrichplot (2018-01-29, Mon)