1.3.4版更改-修复了在Windows上运行测试时由于testthat::context和testthat::expect_equal在bplapply调用中未继承的命名空间导入的错误-调试CoreGx更新导致的BioC构建错误1.3.2版更改-修复了computeLimmaDiffExpr中的一个错误,其中子集ToxicoSet不会子集summarize实验的protocolData。导致函数内部的ExpressionSet强制失败-目前只是从summarizeexperiment的元数据中删除protocolData,但最终需要在1.3.1版本的ORCESTRA更改中进行上游修复-分子配置数据现在是测试中的子集,以保持包的大小减小- 1.3.0版本的更改-春季2021 Bioconductor发布!1.1.0版本的更改-继续将功能抽象到CoreGx -增加额外的绘图功能,如分组箱图-将单元测试的覆盖率扩展到>90% -实现更快版本的drugPertubationSignature -增加额外的绘图功能-包括用于差异表达分析的脚本和毒理学基因组数据的GSEA (limma) 1.0.0版本的更改-在CRAN上存档的包-提交给bioconductor的包-修改包以依赖更新的CoreGx -所有molecularProfiles现在都是summarize实验而不是ExpressionSet -抽象了一些额外的函数到CoreGx版本的变化-更新了downloadTSet函数,使用发布的Zenodo DOIs来检索数据-修改了rankGeneDrugsPerturbation,以修复一个坏的单位转换,它会返回错误的单位浓度0.1.1版本的变化-错误修复:重新生成TGGATESsmall(样本数据集),以修复与先前版本一致的小插图中的结果。0.1.0版更改-使用ggplot2重写了绘图,以提高美观性-现在也可以使用标准ggplot2语法扩展绘图函数-改进了包文档-提交了最小包