版本1.30.0的更改将createClusterMST()迁移到trajectory yutils包。o修改了orderCells()以返回一个信息更丰富的pseudotimeorders对象。o处理testPseudotime()中的伪时间矩阵,分别测试每条路径。支持包含自定义行。data=在每个输出的DataFrame。1.28.0版更改o添加了createClusterMST(),以从scran包迁移的各种输入创建基于集群的MST。o增加了reporttedges()来报告绘图的边缘坐标。o添加了mapCellsToEdges()来将单元格映射到MST上最近的边。o增加了orderCells()来计算映射单元的伪时间顺序。o增加了quickPseudotime()将MST构造和排序包装成单个调用。o增加了testPseudotime()测试DE基因沿着一条或多条路径通过MST。 o Added the rowmean() utility to compute column means for row groupings. o Added perCellEntropy() to compute per-cell entropies across various matrix types.