1.15.2版本的变化- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -新ChIP-Gene数据库:*为人类和小鼠使用ReMap2022集合。*添加细胞特殊监管区域预测ABC-Enhancer-Gene-Prediction (doi: 10.1038 / s41588 - 019 - 0538 - 0)。新功能:*新数据库格式(旧的数据库仍兼容)。列表的格式由包含两个元素:-基因键:向量的基因id -芯片目标:向量的列表,每个ChIP-seq实验中,一个包含假定的目标分配。编码为每个目标的位置向量“基因键”。*数据库生成精简了拼接功能GR2tfbs_db()和makeTFBSmatrix()成一个,makeChIPGeneDB ()。新的默认数据库:* TFEA附带TF-Gene数据库。芯片建成使用重新映射的ChIP-seq集合(v . 2022)和GeneHancer双精英监管区域(v . 4.8)。由于内存限制,内部数据库包含在TFEA。芯片只能存储一个8000 +的分数ChIP-seq colection实验。 We selected the 926 ChIP-seq experiments done in ENCODE Project's Common Cell Types. To download the full database, as well as other ready-to-use databases generated for TFEA.ChIP, visit: https://github.com/LauraPS1/TFEA.ChIP_downloads