版本1.10.0变化- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o Bug修复和改进文档版本1.8.0的变化- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o Bug修复和其他改进版本1.6.0变化- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o新装饰图案o SGVariants和SGVariantCounts类的变化。与以前版本的实例创建SGSeq必须更新。o取代函数访问分析数据有两个通用函数计算()和FPKM()支持BamFileLists样本信息o改变行为的注释()函数当分配基因名字o min_denominator改变行为的观点analyzeVariants()和getSGVariantCounts ()。specfied最低数已达到在事件的开始或结束。o相邻的外显子不再导致convertToTxFeatures警告()o弃用遗产类TxVariants TxVariantCounts o Bug修复和其他改进版本1.4.0变化- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o添加importTranscripts()进口人造石铺地面的注释格式添加plotCoverage阿()的可视化每读覆盖率和结读计数o添加predictVariantEffects()预测剪接变异的影响带注释的蛋白质编码转录o findSGVariants()现在可以处理更复杂的基因模型o SGVariants列closed5p现在closed3p指个体拼接变异而不是拼接事件他们属于o Bug修复和其他改进版本1.2.0变化- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o重命名类TxVariants SGVariants o重命名类TxVariantCounts SGVariantCounts o findTxVariants () findSGVariants更名为getTxVariantCounts阿()()getSGVariantCounts () o并行控制与一个核心论点o参数max_complexity predictTxFeatures()控制问题地区的跳过o getBamInfo()不再是运行的一部分analyzeFeatures getSGVariantCounts阿()()现在支持从BAM获得重要文件o Bug修复和其他改进