ORFik 1.0.0 ----------------------- o ORFik的第一个版本-找到开放阅读框架，自动RiboSeq足迹偏移，使用CageSeq重新分配转录起始位点，从科学出版物的大量基因身份函数的变化在版本1.1.12 -----------------------显著的用户可见的变化o重做许多函数处理没有名字正确，像tile1现在将工作即使GRangesList没有名字。文档更符合逻辑，并删除了coverageByWindow，因为GenomicFeatures::coverageByTranscripts现在可以正确工作。在版本1.1.12的变化-------------------------显著用户可见的变化o orf查找函数现在找到最长的orf每个停止密码子，如果你设置longestORF = TRUE在findORFS, findMapORFs和findORFsFasta变化在版本1.3.7 -------------------------显著用户可见的变化o mapToGRanges现在更快，使用更少的内存。一个来自基因组特征的pmapFromTranscripts的c++重新实现。版本1.7.0的变化-------------------------用户可见的重大变化ORFik实验语法已经准备好，以简化ORFik与大数据的使用。版本1.7.17的变化-------------------------用户可见的重大变化o增加了pmapToTranscriptsF，一个更快的pmapToTranscripts。o所有ORFik现在都支持表示重复读取的权重。这将大大加快与NGS数据相关的所有功能。在版本1.13.7的变化-------------------------显著的用户可见的变化o在覆盖pertiling的速度大幅提高o改进的p移分析(也增加了详细输出)o增加可能的优化注释重写小插图