1.1.5版更改(2016-08-23)+我们修复了. addtlb()(由estimateTechnicalNoise()调用)中的一个错误，该错误减少了使用的转计数容器的数量，尽管这些容器中的读计数仍然被正确计算。由于修复这个错误增加了转运计数箱的数量，我们相应地调整了两个设置的默认值:o tlb。minProxOEPerBin: 1000更改为50,000 o tlb。minProxB2BPerBin: 100更改为2500 o选择这些值是为了确保结果与Chicago 1.1.4的变化尽可能小。除非使用自定义值，否则不应该注意到任何质的差异。o如果您需要在使用1.1.4或更早版本创建的chicagoData对象上重新运行chicagoPipeline()(或只是estimateTechnicalNoise())，请手动更新参数到其新设置:minproxb2bperbin =50000, tlb.minProxB2BPerBin=2500)) o非常感谢Thomas Sexton让我们注意到这个错误并帮助我们修复它。版本1.13(2019-24-10)+默认值的更改现在基于.npb文件头进行更新，而不仅仅是检查它们的一致性。+当使用Chicago和四切酶时，确保降低minFragLen参数。然而，这现在只能在生成设计文件时完成，而不能在R包本身中完成。1.17.1版本更改(2020-09-08)+修复了一个在某些情况下影响距离函数估计的小错误，特别是在使用四切酶时。