WigglePlotr
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doi：10.18129/b9.bioc.wiggleplotr
这是发展WigglePlotr的版本;对于稳定版本，请参阅WigglePlotr。
从Bigwig文件中读取覆盖范围
生物导体版本：开发（3.16）
可视化测序实验的读取覆盖范围以及基因组注释（基因，转录本，峰）的工具。长转录本的内含子可以重新缩放至固定长度，以更好地可视化外显子读覆盖范围。
作者：Kaur Alasoo [AUT，CRE]
维护者：gmail.com上的Kaur Alasoo
引用（从r内，输入引用（“ WigglePlotr”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ wiggleplotr”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ wiggleplotr”）
| html | R脚本 | WigglePlotr简介 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 替代方案，，，，chipseq，，，，覆盖范围，，，，基因表达，，，，免疫学，，，，rnaseq，，，，测序，，，，软件，，，，转录，，，，可视化 |
| 版本 | 1.21.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.5（R-3.4）（5年） |
| 执照 | Apache许可证2.0 |
| 要看 | R（> = 3.6） |
| 进口 | dplyr，，，，GGPLOT2（> = 2.2.0），基因组机，，，，rtracklayer，，，，牛仔图，，，，断言，，，，purrr，，，，S4VECTORS，，，，iranges，，，，GenomeInfodB |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，rmarkDown，，，，Biomart，，，，GenomicFeatures，，，，测试，，，，Ensembldb，ensdb.hsapiens.v86，org.hs.eg.db，txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nowngene，AnnotationDbi，，，，AnnotationFilter |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | wigglePlotr_1.21.0.tar.gz |
| Windows二进制 | wigglePlotr_1.21.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | wigglePlotr_1.21.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/wiggleplotr |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/wiggleplotr |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/wiggleplotr/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
