waddR

DOI:10.18129 / B9.bioc.waddR

这是发展waddR版本;稳定的发布版本,请参阅waddR。

统计测试来检测基于2-Wasserstein微分分布距离

Bioconductor版本:发展(3.17)

包提供了统计测试基于2-Wasserstein距离两个分布差异的观察与描述样本的形式给出。函数计算2-Wasserstein距离和测试提供的微分分布,以及专门测试微分表达式在单细胞核糖核酸测序数据。

作者:罗马Schefzik (aut),朱利安Flesch (cre)

维护人员:朱利安Flesch < julianflesch gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“waddR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“waddR”)

HTML	R脚本	waddR
HTML	R脚本	wasserstein_metric
HTML	R脚本	wasserstein_singlecell
HTML	R脚本	wasserstein_test
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DifferentialExpression,SingleCell,软件,StatisticalMethod
版本	1.13.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (r - 3.6)(3年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 3.6.0)
进口	Rcpp(> = 1.0.1),手臂(> = 1.10 - 1),伊娃,BiocFileCache,BiocParallel,SingleCellExperiment、并行、方法、统计数据
链接	Rcpp,RcppArmadillo
建议	knitr,devtools,testthat,roxygen2,rprojroot,rmarkdown,嘘
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/goncalves-lab/waddR.git
BugReports	https://github.com/goncalves-lab/waddR/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	waddR_1.13.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/waddR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ waddR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/waddR/
包下载报告	下载数据