uncoverappLib

DOI:10.18129 / B9.bioc.uncoverappLib

这是发展uncoverappLib的版本;稳定版请参见uncoverappLib．

碱基对水平序列覆盖的临床评估的交互式图形应用

Bioconductor版本:开发(3.14)

一个闪亮的应用程序，包含一套图形和统计工具，以支持低覆盖率地区的临床评估。它显示了三个网页，每个网页提供了不同的分析模块:覆盖率分析，通过等位基因频率应用程序计算AF和二项分布。

作者:Emanuela Iovino [cre, aut]， Tommaso Pippucci [aut]

维护者:Emanuela Iovino < Emanuela。Iovino在unibo， >

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("uncoverappLib")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“uncoverappLib”)

超文本标记语言	R脚本	uncoverappLib
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	注释，报道，软件，可视化
版本	1.3.0
在Bioconductor	BioC 3.12 (R-4.0)(0.5年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于
进口	减价，闪亮的，shinyjs，shinyBS，shinyWidgets，shinycssloaders，DT，GvizHomo.sapiens,openxlsx，condformat，stringr， org.Hs.eg.db, TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene，BiocFileCache，rappdirsTxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,rlist， utils, EnsDb.Hsapiens。v75 EnsDb.Hsapiens.v86,OrganismDbiBSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,processx，Rsamtools，GenomicRanges
链接
建议	BiocStyle，knitr，testthat，rmarkdown，dplyr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/Manuelaio/uncoverappLib
BugReports	https://github.com/Manuelaio/uncoverappLib/issues
全靠我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	uncoverappLib_1.3.0.tar.gz
Windows二进制	uncoverappLib_1.3.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	uncoverappLib_1.3.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/uncoverappLib
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/uncoverappLib
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/uncoverappLib/
软件包下载报告	下载数据