扳机

doi：10.18129/b9.bioc.trigger

这是发展触发器的版本；对于稳定版本，请参阅扳机。

转录调节基因表达遗传学的推断

生物导体版本：开发（3.16）

该R软件包为整合基因组数据提供了统计分析的工具，该数据涉及以下组合：基因型，高维中间性状（例如，基因表达，蛋白质丰度）和高阶性状（表型）。该软件包包括以下功能：（1）在遗传标记和基因表达之间构造全局链接图；（2）分析多基因链接（epipitasis）的基因表达；（3）量化每个基因座解释的全基因组变异的比例，并识别EQTL热点；（4）估计成对的因果基因调节概率并构建基因调节网络；（5）确定因果基因的定量特征。

作者：Lin S. Chen ，Dipen P. Sangurdekar 和John D. Storey

维护者：John D. Storey 的Jstorey>

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ trigger”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“触发”）

PDF	R脚本	触发教程
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	基因表达，，，，遗传因素，，，，遗传学，，，，微阵列，，，，SNP，，，，软件
版本	1.43.0
在生物导体中	Bioc 2.9（R-2.14）（10。5年）
执照	GPL-3
要看	r（> = 2.14.0），公司，，，，QTL
进口	QVALUE，方法，图形，SVA
链接
建议
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	trigger_1.43.0.tar.gz
Windows二进制	trigger_1.43.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	trigger_1.43.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/trigger
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/触发器
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/trigger/
软件包下载报告	下载统计