这是发展版本的tra利用;稳定的发布版本,请参阅tra利用。
Bioconductor版本:发展(3.18)
tra利用执行GWAS trait-associated SNP浓缩在基因组分析间隔使用不同的假设检验方法,还提供了各种功能探索和可视化结果。
作者:陈,朝晖S.Qin
维护人员:李陈<李。陈在emory.edu >
从内部引用(R,回车引用(“tra利用”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“tra利用”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“tra利用”)
R脚本 | 执行GWAS trait-associated SNP浓缩在基因组分析间隔 | |
参考手册 |
biocViews | 对齐,报道,DataImport,遗传学,质量控制,测序,软件 |
版本 | 1.31.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.2 (r - 3.2)(7.5年) |
许可证 | GPL |
取决于 | R (> = 3.5.0),GenomicRanges,IRanges,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 |
进口 | |
链接 | |
建议 | BiocStyleRUnit,BiocGenerics |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | traseR_1.31.0.tar.gz |
Windows二进制 | traseR_1.31.0.zip |
macOS二进制(x86_64) | traseR_1.31.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | traseR_1.31.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/traseR |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ tra利用 |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/traseR/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/traseR/ |
包下载报告 | 下载数据 |