这是发展石棉水泥板的版本;稳定的发布版本,请参阅石棉水泥板。
Bioconductor版本:发展(3.18)
石棉水泥板是一种计算方法,允许监管作用的综合分析rna结合蛋白在各种细胞过程利用先前存在的基因表达数据和当前绑定偏好的rna结合蛋白的知识。
作者:康斯坦丁Krismer (cre aut, cph],安娜Gattinger (aut)
,迈克尔Yaffe[解说,cph]
,伊恩Cannell(黑色)
维护人员:康斯坦丁Krismer < Krismer mit.edu >
从内部引用(R,回车引用(“石棉水泥板”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“石棉水泥板”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“石棉水泥板”)
HTML | R脚本 | 光谱主题分析(SPMA) |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | DifferentialExpression,GeneExpression,GeneSetEnrichment,遗传学,微阵列,软件,转录,mRNAMicroarray |
版本 | 1.19.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.8 (r - 3.5)(4.5年) |
许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
取决于 | R (> = 3.5) |
进口 | BiocGenerics(> = 0.26.0),Biostrings(> = 2.48.0)dplyr (> = 0.7.6),GenomicRanges(> = 1.32.6)ggplot2 (> = 3.0.0), ggseqlogo (> = 0.1), grDevices, gridExtra(> = 2.3),方法,平行,Rcpp(> = 1.0.4.8)量表(> = 1.0.0)统计,TFMPvalue(> = 0.0.8),跑龙套 |
链接 | Rcpp (> = 1.0.4.8) |
建议 | knitr (> = 1.20), rmarkdown (> = 1.10), roxygen2 (> = 6.1.0) testthat(> = 2.1.0的) |
SystemRequirements | c++ 11 |
增强了 | |
URL | https://transite.mit.edu |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | transite_1.19.0.tar.gz |
Windows二进制 | transite_1.19.0.zip |
macOS二进制(x86_64) | transite_1.19.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/transite |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/石棉水泥板 |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/transite/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/transite/ |
包下载报告 | 下载数据 |