transformGamPoi

DOI:10.18129 / B9.bioc.transformGamPoi

这是发展transformGamPoi版本;稳定的发布版本,请参阅transformGamPoi。

方差稳定Gamma-Poisson模型的转换

Bioconductor版本:发展(3.18)

Variance-stabilizing转换heteroskedastic数据的分析(即提供帮助。、数据的方差不是常数,如统计数据)。这个包提供了两种类型的方差稳定转换:(1)方法基于三角法(如“作用”,“日志(x + 1)”),(2)模型基于残余(皮尔森和随机分位数残差)。

作者:江诗丹顿Ahlmann-Eltze (aut (cre)

维护人员:江诗丹顿Ahlmann-Eltze < artjom31415 googlemail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“transformGamPoi”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“transformGamPoi”)

HTML	R脚本	glmGamPoi快速入门
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	归一化,预处理,回归,SingleCell,软件
版本	1.5.1
Bioconductor自	BioC 3.14 (r - 4.1)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	glmGamPoi,DelayedArray矩阵,MatrixGenerics,SummarizedExperiment,HDF5Array、方法、跑龙套Rcpp
链接	Rcpp
建议	testthat,TENxPBMCData,食物knitr rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/const-ae/transformGamPoi
BugReports	https://github.com/const-ae/transformGamPoi/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	transformGamPoi_1.5.1.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/transformGamPoi
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ transformGamPoi
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/transformGamPoi/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/transformGamPoi/
包下载报告	下载数据