tracktables

DOI:10.18129 / B9.bioc.tracktables

这是发展tracktables版本;稳定版请参见tracktables．

构建IGV跟踪和HTML报告

Bioconductor版本:开发(3.17)

在HTML页面中创建复杂IGV基因组浏览器会话和动态IGV报告的方法。

作者:Tom Carroll, Sanjay Khadayate, Anne Pajon，梁紫薇

维护者:Tom Carroll

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("tracktables")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“tracktables”)

PDF	R脚本	创建带有跟踪表的IGV HTML报告
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ReportWriting，测序，软件
版本	1.33.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(八年)
许可证	GPL (>= 3)
取决于	R (>= 3.5.0)
进口	IRanges，GenomicRanges，XVector，Rsamtools，XML，tractor.base，stringr，RColorBrewer、方法
链接
建议	knitr，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	tracktables_1.33.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tracktables
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/tracktables
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/tracktables/
软件包下载报告	下载数据