TrackViewer

doi：10.18129/b9.bioc.TrackViewer

这是发展TrackViewer的版本;对于稳定版本，请参阅TrackViewer。

带有Web界面的R/Bioconductor软件包，用于绘制优雅的交互式曲目或Lollipop图，以促进对多媒体数据的综合分析

生物导体版本：开发（3.16）

可视化映射的读取与注释作为NGS数据集的轨道层，例如芯片seq，rna-seq，miRNA-seq，dna-seq，SNP和甲基化数据。

作者：Jianhong OU [AUT，CRE]，朱莉·莉亚（Julie Lihua Zhu）[aut]

维护者：jianhong ou

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ trackViewer”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ TrackViewer”）

html	R脚本	TractViewer Vignette：更改轨道样式
html	R脚本	TractViewer Vignette：蒲公英
html	R脚本	TractViewer Vignette：Lollipopplot
html	R脚本	TrackViewer Vignette：概述
html	R脚本	TrackViewer Vignette：绘图交互数据
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	软件，，，，可视化
版本	1.33.5
在生物导体中	Bioc 2.14（R-3.1）（8。5年）
执照	GPL（> = 2）
要看	r（> = 3.5.0），grdevices，方法，基因组机， 网格，RCPP
进口	GenomeInfodB，，，，基因组签名，，，，GenomicFeatures，，，，GVIZ，，，，rsamtools，，，，S4VECTORS，，，，rtracklayer，，，，生物基因，，，，秤， 工具，iranges，，，，AnnotationDbi，，，，格里姆波特，，，，htmlwidgets，，，，plotrix，，，，rgraphviz，，，，互动集，，，，图形，utils，RHDF5
链接	RCPP
建议	Biomart，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，运行，，，，org.hs.eg.db，，，，生物使用，，，，尼特，，，，变体，，，，httr，，，，htmltools，，，，rmarkDown，，，，Motifstack
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我	NADFINDER
建议我	atacseqqc，，，，Chippeakanno
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	TrackViewer_1.33.5.tar.gz
Windows二进制	TrackViewer_1.33.5.zip
MacOS 10.13（高山脉）	TrackViewer_1.33.5.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/trackviewer
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/trackViewer
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/trackviewer/
软件包下载报告	下载统计