tidySingleCellExperiment

DOI:10.18129 / B9.bioc.tidySingleCellExperiment

这是发展tidysinglecelexperiment版本;稳定版请参见tidySingleCellExperiment．

将singlecelexperiment带到Tidyverse

Bioconductor版本:开发(3.16)

tidysinglecel实验是一个适配器，它以tibble的形式抽象出' singlecel实验'容器，并允许使用'tidyverse'进行数据操作、绘图和嵌套。

作者:Stefano Mangiola [aut, cre]

维护者:Stefano Mangiola

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install(" tidysinglecel实验")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“tidySingleCellExperiment”)

超文本标记语言	R脚本	tidysinglecel实验包概述
PDF		参考手册

细节

biocViews	AssayDomain，聚类，DifferentialExpression，GeneExpression，基础设施，归一化，质量控制，RNASeq，测序，软件
版本	1.7.0
在Bioconductor	BioC 3.12 (R-4.0)(2年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.0.0)，ttservice，SingleCellExperiment
进口	SummarizedExperiment，dplyr，宠物猫，tidyr，ggplot2，情节，magrittr，rlang，purrr，生命周期，方法，utils，S4Vectors，tidyselect，省略，支柱，stringr，cli，fansi
链接
建议	BiocStyle，testthat，knitr，减价，SingleCellSignalR，单，嘘，食物，tidyHeatmap，igraph，GGally，矩阵，uwot，celldex，dittoSeq，EnsDb.Hsapiens.v86
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/stemangiola/tidySingleCellExperiment
BugReports	https://github.com/stemangiola/tidySingleCellExperiment/issues
全靠我
进口我
建议我	sccomp
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	tidySingleCellExperiment_1.7.0.tar.gz
Windows二进制	tidySingleCellExperiment_1.7.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	tidySingleCellExperiment_1.7.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tidySingleCellExperiment
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ tidysinglecel实验
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/tidySingleCellExperiment/
软件包下载报告	下载数据