目标

DOI:10.18129 / B9.bioc.target

这是发展版本的目标;稳定的发布版本,请参阅目标。

预测转录因子的功能相结合

Bioconductor版本:发展(3.18)

实施探讨出β算法直接从dna结合蛋白和扰动目标基因表达数据王et al。(2013) 。扩展算法来预测两个dna结合蛋白的结合功能元素从comprable绑定和表达数据。

作者:马哈茂德•艾哈迈德(aut (cre)

维修工:马哈茂德•艾哈迈德< mahmoud.s。法米在students.kasralainy.edu.eg >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“目标”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“目标”)

HTML	R脚本	使用目标预测结合绑定
HTML	R脚本	使用目标的包
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文本		新闻

细节

biocViews	软件,StatisticalMethod,转录
版本	1.15.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (r - 3.6)(3.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.6)
进口	BiocGenerics,GenomicRanges,IRanges、matrixStats、方法、数据、图形、有光泽
链接
建议	testthat(> =魅惑,knitr rmarkdown, shinytest, shinyBS covr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/MahShaaban/target
BugReports	https://github.com/MahShaaban/target/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	target_1.15.0.tar.gz
Windows二进制	target_1.15.0.zip
macOS二进制(x86_64)	target_1.15.0.tgz
macOS二进制(arm64)	target_1.15.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/target
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/目标
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/target/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/target/
包下载报告	下载数据