tRNAscanImport

DOI:10.18129 / B9.bioc.tRNAscanImport

这是发展tRNAscanImport版本;稳定版请参见tRNAscanImport．

导入tRNAscan-SE结果文件作为GRanges对象

Bioconductor版本:开发(3.16)

该包将tRNAscan-SE的结果作为GRanges对象导入。

作者:Felix G.M. Ernst [aut, cre]

维护者:Felix G.M. Ernst < Felix .gm。恩斯特在outlook.com>上写道

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("tRNAscanImport")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“tRNAscanImport”)

超文本标记语言	R脚本	tRNAscanImport
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DataImport，预处理，软件，可视化，WorkflowStep
版本	1.17.0
在Bioconductor	BioC 3.7 (R-3.5)(4年)
许可证	GPL-3 +文件许可证
取决于	R (>= 3.5)，GenomicRanges，tRNA
进口	方法,stringr，BiocGenerics，Biostrings，Structstrings，S4Vectors，IRanges，XVector，GenomeInfoDb，rtracklayer，BSgenome，Rsamtools
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat，ggplot2，BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/FelixErnst/tRNAscanImport
BugReports	https://github.com/FelixErnst/tRNAscanImport/issues
全靠我
进口我
建议我	Structstrings，tRNA
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	tRNAscanImport_1.17.0.tar.gz
Windows二进制	tRNAscanImport_1.17.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	tRNAscanImport_1.17.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tRNAscanImport
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/tRNAscanImport
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/tRNAscanImport/
软件包下载报告	下载数据