Synlet

doi:10.18129/b9.bioc.synlet

这是发展Synlet的版本;对于稳定版本,请参阅Synlet

合成致命RNAi屏幕数据的命中选择

生物导体版本:开发(3.16)

从合成致命的RNAi屏幕数据中选择命中。例如,除一个基因在一个细胞系中被撞倒外,有两个相同的细胞线。兴趣是找到在被siRNA进一步击倒时会导致更强致命作用的基因。实施了质量控制和各种可视化工具。可以使用四种不同的算法来拾取有趣的命中。该软件包是基于384个井板设计的,但可能适用于具有正确配置的其他平台。

作者:chunxuan shao

维护者:chunxuan shao

引用(从r内,输入引用(“ synlet”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ synlet”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ synlet”)

html R脚本 Synlet的工作演示
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 蜂窝基,,,,特征提取,,,,免疫学,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,软件,,,,可视化
版本 1.27.0
在生物导体中 Bioc 3.2(R-3.2)(7年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.2.0),GGPLOT2
进口 多比,,,,dplyr, 网格,马格里特,,,,rcolorbrewer,,,,rankprod,,,,RESHAPE2
链接
建议 尼特,,,,测试,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Synlet_1.27.0.tar.gz
Windows二进制 Synlet_1.27.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) Synlet_1.27.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/synlet
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/synlet
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/synlet/
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