这是发展Synlet的版本;对于稳定版本,请参阅Synlet。
生物导体版本:开发(3.16)
从合成致命的RNAi屏幕数据中选择命中。例如,除一个基因在一个细胞系中被撞倒外,有两个相同的细胞线。兴趣是找到在被siRNA进一步击倒时会导致更强致命作用的基因。实施了质量控制和各种可视化工具。可以使用四种不同的算法来拾取有趣的命中。该软件包是基于384个井板设计的,但可能适用于具有正确配置的其他平台。
作者:chunxuan shao
维护者:chunxuan shao
引用(从r内,输入引用(“ synlet”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ synlet”)的用法
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ synlet”)
html | R脚本 | Synlet的工作演示 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 蜂窝基,,,,特征提取,,,,免疫学,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.27.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.2(R-3.2)(7年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 3.2.0),GGPLOT2 |
进口 | 多比,,,,dplyr, 网格,马格里特,,,,rcolorbrewer,,,,rankprod,,,,RESHAPE2 |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,测试,,,,rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Synlet_1.27.0.tar.gz |
Windows二进制 | Synlet_1.27.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | Synlet_1.27.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/synlet |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/synlet |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/synlet/ |
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