switchde

DOI:10.18129 / B9.bioc.switchde

这是发展switchde版本;稳定的发布版本,请参阅switchde。

开关类微分表达式在单细胞轨迹

Bioconductor版本:发展(3.17)

推理和检测开关类微分表达式在单细胞RNA-seq轨迹。

作者:基兰·坎贝尔(aut (cre)

维修工:基兰·坎贝尔在gmail.com < kieranrcampbell >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“switchde”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“switchde”)

HTML	R脚本	switchde包的概述
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,ImmunoOncology,RNASeq,回归,SingleCell,软件,转录组
版本	1.25.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(6.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.4),SingleCellExperiment
进口	SummarizedExperiment,dplyr,ggplot2、方法、统计数据
链接
建议	knitr,rmarkdown,BiocStyle,testthat,numDeriv,tidyr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/kieranrcampbell/switchde
BugReports	https://github.com/kieranrcampbell/switchde
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	switchde_1.25.0.tar.gz
Windows二进制	switchde_1.25.0.zip
macOS二进制(x86_64)	switchde_1.25.0.tgz
macOS二进制(arm64)	switchde_1.25.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/switchde
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ switchde
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/switchde/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/switchde/
包下载报告	下载数据