这是发展Suprahex的版本;对于稳定的版本版本,请参阅suprahex.。
Bioconducts版本:开发(3.14)
超六边形地图是一个巨大的六角形,位于2维网格上,由较小的六边形组成。它应该训练,分析和可视化高维的OMIC输入数据。Suprahex能够进行基因聚类/元聚类和样本相关性,加上直观的可视化,以促进探索性分析。更重要的是,它允许将附加数据覆盖到培训的地图上,以探索输入和附加数据之间的关系。因此,对于Suprahex,还可以执行多层OMICS数据比较。新增的公用事业是先进的热爱可视化和基于树的样本关系分析。唯一对此包装,用户可以在科学和艺术上超越任何表格常规数据,尤其是特定样本的时尚,但不损失大基因的信息。
作者:海芳和朱利安毒药
维护者:Hai Fang
引文(从R内,输入引文(“Suprahex”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)#以下初始化Buoc Devel Biocmanager :: Install(版本='devel')BiocManager :: Install(“Suprahex”)的使用
对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放。
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
Browsevignettes(“Suprahex”)
PDF. | r script. | Suprahex用户手册 |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | 聚类那基因表达那软件那可视化 |
版本 | 1.31.0. |
在生物导体中以来 | BIOC 2.13(R-3.0)(7.5岁) |
执照 | GPL-2 |
依靠 | r(> = 3.6),六己 |
进口 | 猿那大量的,grdevices,图形,统计数据,读书那娇媚那Tidyr.那dplyr.那stringr.那邮风那Magrittr.那iGraph., 方法 |
链接到 | |
建议 | |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | http://suprahex.r-forge.r-project.org. |
取决于我 | DNET. |
进口我 | PI. |
建议我 | tcgabiolinks. |
链接给我 | |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
源包 | suprahex_1.31.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | |
Macos 10.13(高塞拉) | suprahex_1.31.0.tgz. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/suprahex. |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.biocondion.org:包/ suprahex |
包短网址 | https://biocumon.org/packages/suprahex/ |
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