- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- subSeq(开发版)
subSeq
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DOI:10.18129 / B9.bioc.subSeq
这是发展subSeq版本;稳定的发布版本,请参阅subSeq。
二次抽样的高通量测序数据
Bioconductor版本:发展(3.17)
二次抽样的高通量测序数据用于实验设计和分析。
作者:大卫罗宾逊,约翰·d·层的贡献安德鲁j .鲈鱼
维修工:安德鲁·j·巴斯< ajbass princeton.edu >,约翰·d·层< jstorey princeton.edu >
从内部引用(R,回车引用(“subSeq”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“subSeq”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“subSeq”)
| R脚本 | subSeq例子 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | DifferentialExpression,GeneExpression,ImmunoOncology,RNASeq,测序,软件,转录 |
| 版本 | 1.29.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.2 (r - 3.2)(7.5年) |
| 许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
| 取决于 | R (> = 3.2) |
| 进口 | data.table,dplyr,tidyr,ggplot2,magrittr,qvalue(> = 1.99),消化,Biobase |
| 链接 | |
| 建议 | limma,刨边机,DESeq2,DEXSeq(> = 1.9.7),testthat,knitr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://github.com/StoreyLab/subSeq |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | subSeq_1.29.0.tar.gz |
| Windows二进制 | subSeq_1.29.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | subSeq_1.29.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | subSeq_1.29.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/subSeq |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ subSeq |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/subSeq/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/subSeq/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
