经验丰富的人

DOI:10.18129 / B9.bioc.stageR

这是发展stageR版本;稳定版请参见经验丰富的人．

stageR:对R中高通量基因表达数据进行分期分析

Bioconductor版本:开发(3.17)

stageR包允许自动分阶段分析高通量基因表达数据。该方法发表在https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-017-1277-0的《基因组生物学》杂志上

作者:Koen Van den Berge和Lieven Clement

维护者:Koen Van den Berge < Koen。Vdberge在gmail.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("stageR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“经验丰富的人”)

超文本标记语言	R脚本	stageR:对R中高通量基因表达数据进行分期分析
PDF		参考手册

细节

biocViews	软件，StatisticalMethod
版本	1.21.0
在Bioconductor	BioC 3.6 (R-3.4)(5年)
许可证	GNU通用公共许可证第三版
取决于	R (>= 3.4)，SummarizedExperiment
进口	方法,统计数据
链接
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle、方法、Biobase，刨边机，limma，DEXSeq，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	rnaseqDTU
进口我
建议我	MethReg，土星
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	stageR_1.21.0.tar.gz
Windows二进制	stageR_1.21.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	stageR_1.21.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	stageR_1.21.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/stageR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/stageR
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/stageR/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/stageR/
软件包下载报告	下载数据