ssPATHS

DOI:10.18129 / B9.bioc.ssPATHS

这是发展ssPATHS版本;稳定的发布版本,请参阅ssPATHS。

ssPATHS:单一样本途径得分

Bioconductor版本:发展(3.18)

这个包生成途径分数表达数据的单一样本训练后在队列的引用。生成的分数是通过一组基因的表达(途径)从队列的引用和执行线性判别分析区分样本的途径增强而不是队列。然后使用分离超平面来评分的新样品。

作者:娜塔莉·r·戴维森

维护人员:娜塔莉·r·戴维森<娜塔莉。戴维森在inf.ethz.ch >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“ssPATHS”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ssPATHS”)

PDF	R脚本	使用ssPATHS
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	BiomedicalInformatics,分类,DimensionReduction,GeneExpression,通路,RNASeq,软件,转录组
版本	1.15.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (r - 3.6)(3.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 3.5.0),SummarizedExperiment
进口	dml, ROCR混乱
链接
建议	ggplot2 testthat(> =魅惑
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ssPATHS_1.15.0.tar.gz
Windows二进制	ssPATHS_1.15.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	ssPATHS_1.15.0.tgz
macOS二进制(arm64)	ssPATHS_1.15.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ssPATHS
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ssPATHS
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ssPATHS/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ssPATHS/
包下载报告	下载数据