飞溅

doi：10.18129/b9.bioc.splatter

这是发展Splatter的版本；对于稳定版本，请参阅飞溅。

单细胞RNA测序数据的简单仿真

生物导体版本：开发（3.16）

Splatter是用于模拟单细胞RNA测序计数数据的软件包。它提供了一个简单的接口，用于创建可重现且有据可查的复杂模拟。可以从真实数据估算参数，并提供功能以比较真实和模拟数据集。

作者：卢克·扎皮亚（Luke Zappia）[AUT，CRE]，Belinda Phipson [AUT]，克里斯蒂娜·阿佐迪[CTB]，Alicia Oshlack [aut]

维护者：Luke Zappia

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ splatter”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“飞溅”）

html	R脚本	溅起包装的介绍
html	R脚本	SPLAT仿真参数
html	R脚本	SPLATPOP模拟
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	基因表达，，，，免疫学，，，，rnaseq，，，，测序，，，，Singlecell，，，，软件，，，，转录组学
版本	1.21.0
在生物导体中	Bioc 3.5（R-3.4）（5年）
执照	GPL-3 +文件执照
要看	r（> = 4.0），Singlecellexperiment
进口	生物基因，，，，生物比较，，，，检查员（> = 2.0.0），EDGER，，，，fitdistrplus，，，，GGPLOT2，，，，Locfit，，，，矩阵， 方法，秤，，，，评分（> = 1.15.16），统计，总结性特征，utils，蜡笔，，，，S4VECTORS，grdevices
链接
建议	生物使用，，，，COVR，，，，牛仔图，，，，魔术，，，，尼特，，，，limsolve，，，，LME4，，，，进步，，，，PSCL，，，，测试，，，，预处理，，，，rmarkDown，，，，SCDD，，，，斯克兰，，，，MFA，，，，苯酚，，，，基本（> = 1.7.10），Zinbwave，，，，sparsedc，，，，生物管理器，，，，拼写，，，，Igraph，，，，砍伐，，，，生物兴奋，，，，变体，，，，生物弦，，，，GenomeInfodB，，，，基因组机，，，，iranges
系统要求
增强
URL	https://github.com/oshlack/splatter
BugReports	https://github.com/oshlack/splatter/issues
取决于我
进口我	Bctsne，脚本
建议我	新浪潮，，，，烤饼，，，，SCPCA，，，，总结
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	Splatter_1.21.0.tar.gz
Windows二进制	Splatter_1.21.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	Splatter_1.21.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/splatter
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/飞溅
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/splatter/
软件包下载报告	下载统计