这是发展Spicyr的版本;对于稳定版本,请参阅spicyr。
生物导体版本:开发(3.16)
Spicyr提供了一系列功能,以帮助分析免疫荧光和质量细胞术成像数据以及其他可以深入表型单个细胞及其空间位置的测定法。
作者:Nicolas Canete [Aut],Ellis Patrick [AUT,CRE]
维护者:埃利斯·帕特里克(Ellis Patrick)
引用(从r内,输入引用(“ Spicyr”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ spicyr”)的用法
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Spicyr”)
html | R脚本 | 分段介绍 |
html | R脚本 | 辛辣简介 |
参考手册 |
生物浏览 | 蜂窝基,,,,Singlecell,,,,软件 |
版本 | 1.9.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.11(R-4.0)(2年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | R(> = 4.1) |
进口 | GGPLOT2,,,,凹者,,,,生物比较,,,,spatstat.core,,,,spatstat.geom,,,,lmertest,,,,生物基因,,,,S4VECTORS,,,,LME4, 方法,MGCV,,,,pheatmap,,,,rlang,grdevices,iranges,统计Data.Table,,,,dplyr,,,,花花公子,,,,骗局 |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/ellispatrick/spicyr/issues |
取决于我 | |
进口我 | Lisaclust |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Spicyr_1.9.0.tar.gz |
Windows二进制 | spicyr_1.9.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | Spicyr_1.9.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/spicyr |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/spicyr |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/spicyr/ |
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