规格

doi：10.18129/b9.bioc.specl

这是发展Specl的版本；对于稳定版本，请参阅规格。

SPECL-准备肽光谱匹配匹配，以用于靶向蛋白质组学

生物导体版本：开发（3.16）

提供了用于生成光谱库的功能，可用于蛋白质组学中的MRM SRM MS工作流程。该软件包提供了Bibliospec读取器，该功能可以使用FastA格式化的氨基酸文件添加蛋白质信息，以及用于在Spectronaut软件中使用创建库的导出方法。该软件包是在功能基因组中心开发，测试和使用的 。

作者：克里斯蒂安·潘斯[AUT，CRE]，乔纳斯·格罗斯曼[aut]，Christian Trachsel [Aut]，Witold E. Wolski [CTB]

维护者：Christian Panse

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ specl”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ specl”）

html	R脚本	自动工作流程
PDF	R脚本	规格简介
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	质谱，，，，蛋白质组学，，，，软件
版本	1.31.0
在生物导体中	Bioc 3.0（R-3.1）（7。5年）
执照	GPL-3
要看	r（> = 3.6），DBI（> = 0.5），方法（> = 3.3），PROTVIZ（> = 0.5），rsqlite（> = 1.1），seqinr（> = 3.3）
进口
链接
建议	生物基因，，，，生物使用（> = 2.2），尼特（> = 1.15），rmarkDown，，，，运行（> = 0.4）
系统要求
增强
URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/specl/
BugReports	https://github.com/fgcz/specl/issues
取决于我
进口我
建议我	MSQC1，，，，雏形
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	specl_1.31.0.tar.gz
Windows二进制	specl_1.31.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	specl_1.31.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/specl
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/specl
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/specl/
软件包下载报告	下载统计