空间Heatmap

doi：10.18129/b9.bioc.spatialheatmap

这是发展spatialHeatMap的版本;对于稳定版本，请参阅空间Heatmap。

空间Heatmap

生物导体版本：开发（3.16）

FasialHeatMap软件包提供了可视化生物学测定的细胞，组织和器官特异性数据的功能，该数据通过根据数字颜色键在解剖图像中定义的相应空间特征着色。

作者：Jianhai Zhang [AUT，TRL，CRE]，Jordan Hayes [aut]，Le Zhang [aut]，Bing Yang [aut]，Wolf Frommer [aut]，Julia Bailey-Serres [aut]，Thomas Girke [aut]

维护者：jianhai Zhang

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ spatialHeatMap”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“空间HeatMap”）

html	R脚本	空间HeatMap：在解剖图像和网络图中可视化空间测定
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	Atacseq，，，，蜂窝基，，，，细胞生物学，，，，聚类，，，，dnaseq，，，，datarepresentation，，，，基因表达，，，，遗传学，，，，GraphandNetwork，，，，微阵列，，，，网络，，，，测序，，，，Singlecell，，，，软件，，，，空间，，，，组织血液阵列，，，，可视化
版本	2.3.0
在生物导体中	Bioc 3.12（R-4.0）（2年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 3.5.0）
进口	av，，，，生物比较，，，，Biocfilecache，，，，Data.Table，，，，deseq2，，，，清楚的，，，，EDGER，，，，WGCNA，，，，flashclust，，，，htmlwidgets，，，，GeneFilter，，，，GGPLOT2，，，，ggdendro，，，，格里姆波特， 网格，栅格，，，，GPLOTS，，，，Igraph，，，，HDF5Array，，，，林玛， 方法，魔术，，，，矩阵，，，，RSVG，，，，闪亮的，，，，DynamiCtreCut，grdevices，图形，ggplotify， 平行，情节，，，，Proc，，，，洛尔，，，，Rappdirs，，，，RESHAPE2，，，，评分，，，，砍伐，，，，斯克兰，统计总结性特征，，，，Singlecellexperiment，，，，发光的dashboard，，，，S4VECTORS，utils，Visnetwork，，，，insctr，，，，XML2，，，，Yaml
链接
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，生物使用，，，，生物兴奋，，，，运行，，，，生物基因，，，，表达，，，，DT，，，，生物酶，，，，地球，，，，闪亮的widgets，，，，Shinyjs，，，，htmltools，，，，丝绸，，，，可分类
系统要求
增强
URL	https://github.com/jianhaizhang/spatialheatmap
BugReports	https://github.com/jianhaizhang/spatialheatmap/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	spatialHeatMap_2.3.0.tar.gz
Windows二进制	spatialHeatMap_2.3.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	spatialHeatMap_2.3.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/spatialheatmap
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/spatialHeatMap
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/spatialheatmap/
软件包下载报告	下载统计