- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- 核材料(开发版)
球形结构
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DOI:10.18129 / B9.bioc.snm
这是发展版报道说;稳定的发布版本,请参阅球形结构。
监督规范化的微阵列
Bioconductor版本:发展(3.17)
核是一个建模策略尤其是专为高通量基因组数据正常化。我们的方法的基本前提是,你的数据是一个我们称之为一些具体变量的函数。这些变量是生物变量代表的目标统计分析,或调整变量代表实验或生物因素引起的设置数据是来自。核方法旨在同时模型所有一些具体变量为了更精确地描述感兴趣的生物或临床变量。
作者:禁闭室Mecham和约翰·d·层< jstorey princeton.edu >
维修工:约翰·d·层< jstorey princeton.edu >
从内部引用(R,回车引用(“核材料”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“核材料”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“核材料”)
| R脚本 | 球形结构教程 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DifferentialExpression,ExonArray,GeneExpression,微阵列,多通道,MultipleComparison,OneChannel,预处理,质量控制,软件,转录,TwoChannel |
| 版本 | 1.47.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.8 (r - 2.13)(12年) |
| 许可证 | LGPL |
| 取决于 | R (> = 2.12.0) |
| 进口 | corpcor,lme4(> = 1.0),样条函数 |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | 边缘,ExpressionNormalizationWorkflow |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | snm_1.47.0.tar.gz |
| Windows二进制 | snm_1.47.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | snm_1.47.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | snm_1.47.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/snm |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/核材料 |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/snm/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/snm/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
