snapCGH

DOI:10.18129 / B9.bioc.snapCGH

这是发展snapCGH版本;稳定的发布版本,请参阅snapCGH。

aCGH数据的分割,正常化和处理

Bioconductor版本:发展(3.16)

分段的方法,正常化和处理aCGH数据;包括绘图函数想象原始和单个和多个分段数据数组。

作者:迈克·l·史密斯,约翰·c·Marioni史蒂文·麦金尼托马斯•Hardcastle娜塔莉·p·索恩

维护人员:约翰Marioni < Marioni在ebi.ac.uk >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“snapCGH”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“snapCGH”)

PDF	R脚本	分割概述
PDF		参考手册

细节

biocViews	CopyNumberVariation,微阵列,预处理,软件,TwoChannel
版本	1.67.0
Bioconductor自	BioC 1.8 (r - 2.3)(16岁)
许可证	GPL
取决于	R (> = 3.5.0)
进口	aCGH,集群,DNAcopy,很高兴、图形、grDeviceslimma、方法、统计数据tilingArray,跑龙套
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	ADaCGH2
建议我	beadarraySNP
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	snapCGH_1.67.0.tar.gz
Windows二进制	snapCGH_1.67.0.zip(64位)
macOS 10.13(高山脉)	snapCGH_1.67.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/snapCGH
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ snapCGH
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/snapCGH/
包下载报告	下载数据