单

DOI:10.18129 / B9.bioc.single

这是发展单一的版本;稳定的发布版本,请参阅单。

准确的共识序列从基因文库的纳米孔读取

Bioconductor版本:发展(3.17)

准确的共识序列从纳米孔读取DNA基因文库。单修正系统误差在纳米孔测序读基因库检索的共识序列变异用条形码标识,只需要几个读取/变体。在预印本doi的更多信息:https://doi.org/10.1101/2020.03.25.007146。

作者:Rocio埃斯帕达(aut (cre)

维护人员:Rocio埃斯帕达< rocio.espada在espci.fr >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(单)

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文档

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HTML	R脚本	单
HTML	R脚本	single_fullcode
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	测序,软件
版本	1.3.3
Bioconductor自	BioC 3.15 (r - 4.2)(0.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 4.0)
进口	Biostrings,BiocGenerics,dplyr,GenomicAlignments,IRanges、方法、reshape2,rlang,Rsamtools统计数据,stringr,tidyr,跑龙套
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	single_1.3.3.tar.gz
Windows二进制	single_1.3.3.zip
macOS二进制(x86_64)	single_1.3.3.tgz
macOS二进制(arm64)	single_1.3.3.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/single
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/单
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/single/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/single/
包下载报告	下载数据