sigPathway

DOI:10.18129 / B9.bioc.sigPathway

这是发展sigPathway版本;稳定版请参见sigPathway

路径分析

Bioconductor版本:开发(3.17)

如Tian et al.(2005)所述,通过计算NT_k和NE_k统计数据进行通径分析。

作者:Weil Lai(优化R和C代码),Lu Tian和Peter Park(算法开发和初始R代码)

维护者:Weil Lai

引文(从R内,输入引用(“sigPathway”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("sigPathway")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

PDF 参考手册

细节

biocViews DifferentialExpressionMultipleComparison软件
版本 1.67.0
在Bioconductor BioC 1.9 (R-2.4)(16.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 2.10)
进口
链接
建议 hgu133a.db(> = 1.10.0),XML(> = 1.6 3),AnnotationDbi(> = 1.3.12)
SystemRequirements
增强了
URL http://www.pnas.org/cgi/doi/10.1073/pnas.0506577102http://www.chip.org/~ppark/Supplements/PNAS05.html
全靠我 tRanslatome
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64) sigPathway_1.67.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sigPathway
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ sigpath
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/sigPathway/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/sigPathway/
软件包下载报告 下载数据

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Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网