shinyMethyl

DOI:10.18129 / B9.bioc.shinyMethyl

这是发展shinyMethyl版本;稳定的发布版本,请参阅shinyMethyl。

交互式可视化的Illumina公司甲基化数组

Bioconductor版本:发展(3.17)

交互式可视化的工具Illumina公司甲基化数组的数据。支持450 k和史诗数组。

作者:让-菲利普•福丁(cre, aut], Kasper丹尼尔·汉森(aut)

维护人员:让-菲利普•福丁< fortin946 gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“shinyMethyl”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“shinyMethyl”)

HTML	R脚本	shinyMethyl:交互式的可视化Illumina公司450 k甲基化数组
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文本		新闻

细节

biocViews	DNAMethylation,MethylationArray,微阵列,预处理,质量控制,软件,TwoChannel
版本	1.35.7
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(8年)
许可证	艺术- 2.0
取决于
进口	Biobase,BiocGenerics、图形、grDeviceshtmltools,MatrixGenerics、方法、minfi,RColorBrewer,闪亮的统计,跑龙套
链接
建议	shinyMethylData,minfiData,BiocStyle,knitr,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/Jfortin1/shinyMethyl
BugReports	https://github.com/Jfortin1/shinyMethyl
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	shinyMethyl_1.35.7.tar.gz
Windows二进制	shinyMethyl_1.35.7.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	shinyMethyl_1.35.7.tgz
macOS二进制(arm64)	shinyMethyl_1.35.7.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/shinyMethyl
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ shinyMethyl
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/shinyMethyl/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/shinyMethyl/
包下载报告	下载数据